MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_022521	AGC	2	6	1552303	1552308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456242
31502	NC_022521	CTG	3	9	1552320	1552328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456242
31503	NC_022521	CTCC	2	8	1552336	1552343	0 %	25 %	0 %	75 %	549456242
31504	NC_022521	ACA	2	6	1552718	1552723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456243
31505	NC_022521	TAT	2	6	1552741	1552746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456243
31506	NC_022521	TCG	2	6	1552808	1552813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456243
31507	NC_022521	CCT	2	6	1552818	1552823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456243
31508	NC_022521	ACG	2	6	1552844	1552849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456243
31509	NC_022521	AGC	2	6	1552918	1552923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456243
31510	NC_022521	GAATA	2	10	1552943	1552952	60 %	20 %	20 %	0 %	549456243
31511	NC_022521	CT	3	6	1552955	1552960	0 %	50 %	0 %	50 %	549456243
31512	NC_022521	TAGG	2	8	1553029	1553036	25 %	25 %	50 %	0 %	549456243
31513	NC_022521	TGG	3	9	1553166	1553174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456243
31514	NC_022521	CAG	2	6	1553499	1553504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456244
31515	NC_022521	ATT	2	6	1553637	1553642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456244
31516	NC_022521	GCG	2	6	1553695	1553700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456244
31517	NC_022521	CAT	2	6	1554112	1554117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456245
31518	NC_022521	TCT	2	6	1554161	1554166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456245
31519	NC_022521	CAT	2	6	1554268	1554273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456245
31520	NC_022521	TCA	2	6	1554276	1554281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456245
31521	NC_022521	AGG	2	6	1554316	1554321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456245
31522	NC_022521	AAC	2	6	1554350	1554355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456245
31523	NC_022521	GGCT	2	8	1554438	1554445	0 %	25 %	50 %	25 %	549456245
31524	NC_022521	TGT	2	6	1554469	1554474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456245
31525	NC_022521	AGC	2	6	1554509	1554514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456245
31526	NC_022521	TCT	2	6	1554782	1554787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456246
31527	NC_022521	CTC	2	6	1554827	1554832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456246
31528	NC_022521	ACG	2	6	1554872	1554877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456246
31529	NC_022521	CTC	2	6	1554931	1554936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456246
31530	NC_022521	CAA	2	6	1555005	1555010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456246
31531	NC_022521	GAC	2	6	1555028	1555033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456246
31532	NC_022521	ACCCTC	2	12	1555039	1555050	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	549456246
31533	NC_022521	TTA	2	6	1555074	1555079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456246
31534	NC_022521	CTT	2	6	1555126	1555131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456246
31535	NC_022521	GTC	2	6	1555138	1555143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456246
31536	NC_022521	TGA	2	6	1555158	1555163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456246
31537	NC_022521	GAA	2	6	1555291	1555296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456247
31538	NC_022521	GATGAA	2	12	1555318	1555329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549456247
31539	NC_022521	TCA	2	6	1555335	1555340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456247
31540	NC_022521	AAG	2	6	1555349	1555354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456247
31541	NC_022521	ATT	2	6	1555371	1555376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456247
31542	NC_022521	TAC	2	6	1555391	1555396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456247
31543	NC_022521	AGC	2	6	1555464	1555469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456247
31544	NC_022521	TAG	2	6	1555523	1555528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456247
31545	NC_022521	TAA	2	6	1555568	1555573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456247
31546	NC_022521	CGG	2	6	1555633	1555638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456247
31547	NC_022521	CGA	2	6	1555641	1555646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456247
31548	NC_022521	AGGGTT	2	12	1555669	1555680	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549456247
31549	NC_022521	AGG	2	6	1555700	1555705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31550	NC_022521	CTC	2	6	1555780	1555785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456247
31551	NC_022521	GAGC	2	8	1555824	1555831	25 %	0 %	50 %	25 %	549456247
31552	NC_022521	AG	3	6	1555860	1555865	50 %	0 %	50 %	0 %	549456247
31553	NC_022521	CTT	2	6	1555960	1555965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456247
31554	NC_022521	GCTC	2	8	1556001	1556008	0 %	25 %	25 %	50 %	549456247
31555	NC_022521	TGATTG	2	12	1556015	1556026	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549456247
31556	NC_022521	CTG	2	6	1556042	1556047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456247
31557	NC_022521	TCC	2	6	1556081	1556086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456247
31558	NC_022521	CGG	2	6	1556126	1556131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456247
31559	NC_022521	CAA	2	6	1556159	1556164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456247
31560	NC_022521	G	7	7	1556180	1556186	0 %	0 %	100 %	0 %	549456247
31561	NC_022521	GTT	2	6	1556275	1556280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456247
31562	NC_022521	CAA	2	6	1556339	1556344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456247
31563	NC_022521	ATAGCG	2	12	1556362	1556373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549456247
31564	NC_022521	GAG	2	6	1556410	1556415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31565	NC_022521	TGT	2	6	1556439	1556444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456247
31566	NC_022521	CAGG	2	8	1556447	1556454	25 %	0 %	50 %	25 %	549456247
31567	NC_022521	CTC	3	9	1556458	1556466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456247
31568	NC_022521	GGA	3	9	1556484	1556492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31569	NC_022521	TATG	2	8	1556570	1556577	25 %	50 %	25 %	0 %	549456247
31570	NC_022521	GAG	2	6	1556581	1556586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31571	NC_022521	GCT	2	6	1556605	1556610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456247
31572	NC_022521	GAG	2	6	1556704	1556709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31573	NC_022521	GGA	2	6	1556730	1556735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31574	NC_022521	TTA	2	6	1556747	1556752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456247
31575	NC_022521	AGC	2	6	1556820	1556825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456247
31576	NC_022521	GAG	2	6	1556865	1556870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456247
31577	NC_022521	CGG	3	9	1557074	1557082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456247
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31580	NC_022521	AGT	2	6	1557515	1557520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456248
31581	NC_022521	ACC	2	6	1557529	1557534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456248
31582	NC_022521	GTA	2	6	1557557	1557562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456248
31583	NC_022521	GAA	3	9	1557609	1557617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456248
31584	NC_022521	GGC	2	6	1557804	1557809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456248
31585	NC_022521	C	6	6	1557835	1557840	0 %	0 %	0 %	100 %	549456248
31586	NC_022521	CGG	2	6	1557947	1557952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456248
31587	NC_022521	GTT	2	6	1558084	1558089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456248
31588	NC_022521	AG	3	6	1558108	1558113	50 %	0 %	50 %	0 %	549456248
31589	NC_022521	CGT	2	6	1558124	1558129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456248
31590	NC_022521	ATA	2	6	1558134	1558139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456248
31591	NC_022521	GCT	2	6	1558166	1558171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456248
31592	NC_022521	AGC	2	6	1558191	1558196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456248
31593	NC_022521	TGGC	2	8	1558199	1558206	0 %	25 %	50 %	25 %	549456248
31594	NC_022521	GCG	2	6	1558231	1558236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456248
31595	NC_022521	GGA	2	6	1558253	1558258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456248
31596	NC_022521	CAA	2	6	1558274	1558279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456248
31597	NC_022521	GA	3	6	1558297	1558302	50 %	0 %	50 %	0 %	549456248
31598	NC_022521	AGG	2	6	1558321	1558326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456248
31599	NC_022521	TA	3	6	1558338	1558343	50 %	50 %	0 %	0 %	549456248
31600	NC_022521	TGG	2	6	1558439	1558444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456248
31601	NC_022521	CTA	2	6	1558463	1558468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456248
31602	NC_022521	GCT	2	6	1558791	1558796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456249
31603	NC_022521	CGC	3	9	1558847	1558855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456249
31604	NC_022521	ACAG	2	8	1558927	1558934	50 %	0 %	25 %	25 %	549456249
31605	NC_022521	AAG	2	6	1559012	1559017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456250
31606	NC_022521	CTA	2	6	1559035	1559040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456250
31607	NC_022521	TGA	2	6	1559041	1559046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456250
31608	NC_022521	AAG	2	6	1559054	1559059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456250
31609	NC_022521	TAGC	2	8	1559067	1559074	25 %	25 %	25 %	25 %	549456250
31610	NC_022521	GGA	3	9	1559092	1559100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456250
31611	NC_022521	TCC	2	6	1559112	1559117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456250
31612	NC_022521	CAG	2	6	1559128	1559133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456250
31613	NC_022521	GGC	2	6	1559195	1559200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456250
31614	NC_022521	TA	3	6	1559234	1559239	50 %	50 %	0 %	0 %	549456250
31615	NC_022521	CGG	2	6	1559277	1559282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456250
31616	NC_022521	TTG	2	6	1559289	1559294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456250
31617	NC_022521	AGG	2	6	1559361	1559366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456250
31618	NC_022521	AGGAT	2	10	1559373	1559382	40 %	20 %	40 %	0 %	549456250
31619	NC_022521	GGT	2	6	1559401	1559406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456250
31620	NC_022521	AGG	2	6	1559457	1559462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456250
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31622	NC_022521	AGG	2	6	1559601	1559606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456250
31623	NC_022521	ATG	2	6	1559616	1559621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456250
31624	NC_022521	GA	3	6	1559653	1559658	50 %	0 %	50 %	0 %	549456250
31625	NC_022521	GGC	2	6	1559778	1559783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456251
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31646	NC_022521	AT	3	6	1560677	1560682	50 %	50 %	0 %	0 %	549456253
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31652	NC_022521	TAG	3	9	1561064	1561072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456254
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31654	NC_022521	AT	3	6	1561132	1561137	50 %	50 %	0 %	0 %	549456254
31655	NC_022521	GCA	2	6	1561183	1561188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456254
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31684	NC_022521	G	8	8	1562492	1562499	0 %	0 %	100 %	0 %	549456256
31685	NC_022521	GAG	2	6	1562501	1562506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456256
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31690	NC_022521	GA	3	6	1562837	1562842	50 %	0 %	50 %	0 %	549456257
31691	NC_022521	ATG	2	6	1562890	1562895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456257
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31700	NC_022521	AAT	2	6	1563257	1563262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456259
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31715	NC_022521	CT	3	6	1564188	1564193	0 %	50 %	0 %	50 %	549456260
31716	NC_022521	TTG	2	6	1564266	1564271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456260
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31719	NC_022521	ATCCT	2	10	1564329	1564338	20 %	40 %	0 %	40 %	549456260
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31723	NC_022521	GGTT	2	8	1564557	1564564	0 %	50 %	50 %	0 %	549456260
31724	NC_022521	CCT	2	6	1564588	1564593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456260
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31729	NC_022521	CT	3	6	1564801	1564806	0 %	50 %	0 %	50 %	549456260
31730	NC_022521	GTA	2	6	1564822	1564827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456260
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31966	NC_022521	CTGCCT	2	12	1578135	1578146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549456272
31967	NC_022521	AGCC	2	8	1578200	1578207	25 %	0 %	25 %	50 %	549456272
31968	NC_022521	AGA	2	6	1578218	1578223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456272
31969	NC_022521	CAC	2	6	1578258	1578263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456272
31970	NC_022521	GTG	2	6	1578337	1578342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456272
31971	NC_022521	TCC	2	6	1578376	1578381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
31972	NC_022521	GTA	2	6	1578417	1578422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456272
31973	NC_022521	CTT	2	6	1578453	1578458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456272
31974	NC_022521	TA	3	6	1578462	1578467	50 %	50 %	0 %	0 %	549456272
31975	NC_022521	GCCT	2	8	1578470	1578477	0 %	25 %	25 %	50 %	549456272
31976	NC_022521	CAA	2	6	1578485	1578490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456272
31977	NC_022521	CCCT	2	8	1578556	1578563	0 %	25 %	0 %	75 %	549456272
31978	NC_022521	CAG	2	6	1578566	1578571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456272
31979	NC_022521	ATCT	2	8	1578603	1578610	25 %	50 %	0 %	25 %	549456272
31980	NC_022521	CCT	2	6	1578633	1578638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
31981	NC_022521	G	6	6	1578675	1578680	0 %	0 %	100 %	0 %	549456272
31982	NC_022521	TAT	3	9	1578790	1578798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456273
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31985	NC_022521	CCT	2	6	1578976	1578981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456274
31986	NC_022521	ACC	2	6	1579040	1579045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456274
31987	NC_022521	ACC	2	6	1579050	1579055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456274
31988	NC_022521	CTC	2	6	1579072	1579077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456274
31989	NC_022521	CTC	2	6	1579088	1579093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456274
31990	NC_022521	GGC	2	6	1579279	1579284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456275
31991	NC_022521	GAG	2	6	1579308	1579313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456275
31992	NC_022521	CCA	2	6	1579315	1579320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456275
31993	NC_022521	GAG	2	6	1579381	1579386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456275
31994	NC_022521	TCCGC	2	10	1579421	1579430	0 %	20 %	20 %	60 %	549456275
31995	NC_022521	GGA	2	6	1579461	1579466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456275
31996	NC_022521	GGAG	2	8	1579507	1579514	25 %	0 %	75 %	0 %	549456275
31997	NC_022521	AGG	2	6	1579555	1579560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456275
31998	NC_022521	GAG	2	6	1579564	1579569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456275
31999	NC_022521	ACC	2	6	1579623	1579628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456275
32000	NC_022521	G	6	6	1579641	1579646	0 %	0 %	100 %	0 %	549456275

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